Бейсуг является третьей по длине и второй по величине стока рекой Азово-Кубанской низменности. Это типичная степная река. Бейсуг в переводе с татарского означает "княжеская" или "главная" река. Истоками Бейсуга являются родники, находящиеся в 9 км на северо-запад от города Кропоткина. Устремляя свой неторопливый бег на северо-запад, река впадает в лиман Бейсугский у станицы Бриньковской, проделав путь в 243 км.
Наиболее крупными притоками ее являются Бейсужек Левый (или Южный Бейсужек) и Бейсужек Правый, имеющие сток воды в течение большей части года. Бейсужек Правый имеет длину 93 км. За небольшим исключением берега Бейсуга пологие. Длина реки хорошо разработана. Почти на всем протяжении реки правый берег ее выше левого.
В своем среднем и нижнем течении Бейсуг весьма извилист, образует местами широкие плесы, многочисленные заливы и старицы. Русло реки поросло влаголюбивой растительностью, среди которой главную роль играют тростники, камыши и осоки. Начиная со станицы Брюховецкой, идут плавни, окаймленные с севера солонцами. Река Бейсуг и ее притоки перегорожены многочисленными плотинами, образующими около 200 прудов. Водный режим реки неустойчив. Половодье здесь происходит весной, но в отдельные годы бывают паводки от выпадающих в бассейне реки ливней. При этом узкое Бейсугское гирло не обеспечивает сток воды из реки в лиман Бейсугский и река выходит из берегов. Этим в значительной мере и объясняется наличие плавней в нижнем течении реки Бейсуга.
В устьевой части реки при ветрах западных направлений наблюдаются нагоны морской воды из Бейсугского лимана. Ледохода обычно не бывает, и лед постепенно тает в прудах.